Le  diagnostic de lupus systémique repose sur l'association de critères cliniques et biologiques. Le lupus systémique étant une maladie auto-immune, on recherche des auto-anticorps lors d'une prise de sang: les plus fréquemment retrouvés sont les anticorps antinucléaires et en particulier les anti-adn natifs (dosés par un test de Far). On observe également une consommation du complément ( ou diminution du CH50) au cours des poussées. En cas de suspicion d'atteinte rénale lors des analyses d'urines, on pratique une ponction biopsie rénale qui peut alors confirmer également le lupus.  Avec les résultats de tout ces examens, on conclut ou non à un lupus systémique, parfois en s'aidant de critères de classification.